صدر قرار معالي الرئيس العام لشؤون المسجد الحرام والمسجد النبوي الشيخ صالح بن عبدالرحمن الحصين بتكليف الدكتور محمد بن عبدالله بن علي باجودة مديراً لمصنع كسوة الكعبة المشرفة لمدة عام اعتباراً من 7/6/1433هـ. والدكتور باجودة التحق بالعمل بمكتبة الحرم المكي  على وظيفة اخصائي تزويد في 21/6/1402هـ وفي عام 1411هـ رشح مساعداً لمدير المكتبة واميناً لها وفي 1/7/1421هـ  عين مديراً لمكتبة الحرم المكي الشريف.

ويحمل الدكتور باجودة درجة بكالوريوس مكتبات ومعلومات عام 1402هـ وعلى درجة الماجستير في الادارة  التربوية والتخطيط عام 1412هـ وشهادة الدكتوراه بامتياز من جامعة أم القرى عام 1420هـ. ومن مؤلفاته نثر القلم في تاريخ مكتبة الحرم، الوجيز في تاريخ مكتبة الحرم المكي الشريف ــ محرك سواكن الغرام الى حج بيت الله وزيارة قبر النبي عليه الصلاة والسلام لمرعى بن يوسف المقدسي (ت 1030هـ) تحقيق ودراسة.، أحكام الاساس في أن أول بيت وضع للناس لمرعى بن يوسف المقدسي (ت 1030هـ) تحقيق ودراسة. وهناك بعض الانتاج العلمي تحت الطبع. شارك ايضا في بعض اصدارات الرئاسة منها الحرمان الشريفان التوسعة والخدمات خلال مائة عام   ــ الحرمان الشريفان في عهد خادم الحرمين الشريفين الملك فهد بن عبدالعزيز رحمه الله النشأة والتطور.